神兽作为稀有且强大的存在，分布在不同地点且需要特定条件触发。急冻鸟位于双子岛最深处，需将岩石推下洞挡住急流才能遭遇，等级为Lv50。闪电鸟固定在无人发电厂最深处出现，同为Lv50。火焰鸟栖息于火焰山山顶，等级与前者一致。这三只传说鸟兽是游戏中最基础的神兽，捕捉时建议携带克制属性的宝可梦以提高成功率。
超梦作为剧情核心神兽，需在完成红蓝宝石任务后前往超梦山洞最深处挑战，等级高达Lv70。梦幻则隐藏在红莲岛的建筑物内，需取得秘密钥匙才能进入对应楼层。洛奇亚位于第八座彩虹岛右下方，等级Lv70，而凤王则出现在同一岛屿左上方草丛中。雪拉比需在三号岛左侧森林探索，迪奥西斯则需在第九座彩虹岛完成拼图后出现，等级仅为Lv30。
古拉顿位于一号岛火焰山地下，冰神柱和钢神柱分别出现在双子岛与无人发电厂。雷公、炎帝、水君则需击败四大天王后，在关东地区草丛随机遭遇，等级均为Lv50。吉拉奇需抵达幽灵塔顶楼，而岩神柱需在岛一上方草地探索。这些神兽的出现机制增加了游戏探索的深度与挑战性。
建议将目标血量削弱至红色状态，并施加睡眠或麻痹等异常状态以提升捕获率。高级球、超级球等道具能显著提高成功率，而大师球建议保留给超梦等难以捕捉的目标。队伍中需配备多种属性宝可梦以应对不同神兽的技能特性，例如用电系对抗急冻鸟，用地面系克制闪电鸟。
游戏后期可通过特定方式解锁隐藏神兽。海皇牙需在双子岛使用钓鱼竿获取，天空之龙潜伏于冠军之路第二层。红水督与蓝水督出没于七号岛最下方海域，需使用冲浪术探索。这些神兽的分布与触发条件体现了游戏设计的复杂性，建议玩家结合攻略与自身探索逐步完成收集。
口袋妖怪火红版的神兽系统兼顾了随机性与策略性，玩家需综合运用地形解谜、剧情推进与战斗技巧才能完成全图鉴。每只神兽的栖息地设计均与其属性特征高度契合，这种细节处理增强了游戏世界的沉浸感与逻辑自洽性。
