二周目通关阵容的核心在于构建属性全面且技能互补的队伍。推荐选择水箭龟作为主力水属性精灵，其高防御和特攻能有效应对火、岩石类型对手。妙蛙花凭借草/毒双属性可压制水系和地面系敌人，同时具备睡眠粉等控场技能。雷丘的高速电系攻击能快速解决飞行和水系目标，而喷火龙的火/飞行属性则能对抗草、虫、冰类型精灵。补充隆隆岩的岩石/地面属性可针对电系和火系威胁，最后搭配急冻鸟的冰/飞行属性形成对龙系和草系的压制。这种组合覆盖了八种主要属性弱点，且每只精灵都有明确的战术定位。
二周目敌方训练家的等级和技能配置显著提升，因此需注重精灵的个体值培养与技能搭配。水箭龟建议携带冲浪、冰冻光束、镜面反射和求雨，形成攻防一体配置。妙蛙花需配备阳光烈焰、污泥炸弹、催眠粉和光合作用，兼顾输出与恢复。雷丘应选择十万伏特、电磁波、光墙和打雷，强化控场能力。喷火龙推荐火焰喷射、空气切割、龙爪和剑舞，发挥速攻优势。隆隆岩需配置地震、岩崩、大爆炸和沙暴，作为终结手段。急冻鸟则搭配冰冻之风、心眼、反射盾和羽栖，增强团队防御。
针对二周目特殊场景如灯火山、火箭队仓库等，队伍需进行临时调整。灯火山区域需强化水箭龟和隆隆岩的出场频率，利用属性克制快速清场。火箭队仓库战斗建议让雷丘首发，通过电磁波限制敌方行动后切换喷火龙进行收割。面对四天王中的冰系科拿时，急冻鸟的反射盾与妙蛙花的阳光烈焰形成双重压制。对抗格斗系天王时，隆隆岩的沙暴与喷火龙的飞行技能可建立优势。龙系天王战需依赖急冻鸟的冰冻之风与水箭龟的冰冻光束进行针对性打击。
精灵的等级分布建议保持在65-75区间，确保属性克制时能一击必杀。水箭龟和隆隆岩作为防御核心需优先提升等级，喷火龙与雷丘则需注重速度个体值培养。妙蛙花和急冻鸟的特攻值直接影响控场效果，建议通过特性胶囊强化相应属性。所有精灵都应携带对应属性的增幅道具，如神秘水滴、奇迹种子等，提升技能威力20%。战斗中需注意敌方可能携带的专爱头巾、气息腰带等道具，通过状态技能破坏其战术节奏。
通关后的隐藏内容如华蓝洞窟超梦挑战，需要重新调整队伍配置。建议将隆隆岩替换为胡地或耿鬼，应对超梦的超能力属性。队伍需额外配备恶系或虫系技能，通过技能机器学习十字剪、咬碎等招式。最终阵容应保持三个物理输出手和三个特殊攻击手的平衡，避免被单一防御类型克制。通过反复挑战战斗塔检验队伍强度，逐步替换弱点明显的成员，最终形成适应全场景的终极阵容。
