口袋妖怪心金中组建最强阵容需要综合考虑属性克制、技能搭配和妖怪成长潜力。火系爆炎鼠、水系大力鳄、草系大菊花作为初始选择各有优势，爆炎鼠前期压制力强但后期稍弱，大力鳄技能池丰富且打击面广，大菊花则擅长消耗战。红色暴鲤龙是中期核心战力，30级即可入手，搭配龙舞强化后能快速推队，其水+飞行属性需注意电系弱点。快龙作为准神兽种族值高达600，但入手较晚，需投入大量培养资源。叉字蝠凭借速度优势可担任先手控制，耿鬼和巨钳螳螂则分别提供特攻与物攻端的爆发。
二周目阵容需针对更高难度的道馆首领和四天王进行调整。超梦在华蓝山洞捕获后成为超能系核心，70级的等级优势配合高特攻能快速清场。三圣鸟中的闪电鸟占据电系输出位，冰冻鸟强化冰系控场能力，火焰鸟则弥补火系缺口。隐藏妖怪如班吉拉和烈咬陆鲨在沙暴队中表现突出，但需要特定地形支持。部分妖怪如画狗可通过素描技能复制密传技，实现功能性替代。
技能搭配方面，物理输出手优先选择剑舞/龙舞强化，搭配本系高威力技能如攀瀑、逆鳞。特攻型妖怪需注重属性覆盖，例如暴鲤龙携带冰之牙应对龙系，快龙配置雷电拳克制水系。辅助角色推荐使用黑色目光+催眠粉的控场组合，或光墙/反射壁等团队增益技能。道具选择上，生命宝珠适合强化爆发，剩饭利于持久战，专爱系列则能针对性提升输出或速度。
后期阵容需平衡攻防节奏与属性联防。水君在剧情中固定出现五次后最终可捕获，其高耐久适合消耗战术。凤王和洛奇亚分别作为版本神兽提供火系与飞行系终极战力，但需完成特定剧情。实用型妖怪如盔甲鸟、幸福蛋能有效抵挡物理或特殊攻击，为队伍提供喘息空间。双打阵容中，天气队与空间队需要精确的速度调整和技能联动，但对操作要求较高。
培养过程中需合理分配努力值，物攻手侧重攻击与速度，坦克型妖怪提升HP与双防。个体值可通过反复捕捉筛选，性格选择以补足短板为主。通信进化妖怪如耿鬼、巨钳螳螂需提前规划获取途径。部分强力妖怪如班吉拉由基拉进化而来，但野生出现概率极低，建议在狩猎区耐心捕捉。队伍中应常备1-2只掌握冲浪、飞天等实用技能的交通工具妖怪。
最终成型阵容推荐两种方向：速攻型以红色暴鲤龙+快龙+闪电鸟为核心，搭配叉字蝠与耿鬼实现高速压制；均衡型则配置超梦+水君+班吉拉，辅以幸福蛋和盔甲鸟形成多层防线。根据剩余对战设施挑战需求，可替换特定counter位妖怪，如格斗系应对恶系，妖精系针对龙系等。实战中需灵活调整出场顺序，利用属性克制链创造优势对位。
